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Häufig gestellte Fragen zu Produkten und Dienstleistungen


Wie wird der Extinktionskoeffizient eines Oligos berechnet?

Der Extinktionskoeffizient bei 260 nm (e260) ist eine eindeutige physikalische Eigenschaft jedes Oligonukleotids. Definiert wird er als die gemessene Absorption bei 260 nm in einer 1 M wässrigen Lösung bei 20°C durch eine optischen Zelle mit einer Durchtrittslänge von 1 cm (Lambert-Beer`sches Gesetz). 

Purin-Basen zeigen eine höhere Absorption als Pyrimidin-Basen. Interaktionen zwischen benachbarten Basen, wie auch Modifikationen, die bei 260 nm absorbieren, beeinflussen ebenfalls die optische Absorption. Somit hängt der Extinktionskoeffizient stark von der Oligosequenz und der Basenanordnung ab.

Die genaueste Methode zur Berechnung des Extinktionskoeffizienten eines Oligos basiert auf dem Nearest-Neighbour-Modell. Mit folgender Formel kann der Extinktionskoeffizient mit einer Varianz von nur 4% berechnet werden:

EC_Formel

Nutzen Sie unser Oligo Analyse Tool zur einfachen Berechnung von Extinktionskoeffizenten.

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