NGSelect Amplicon
Next Generation Sequenzierung von Amplikons in fast jeder Größe
NGSelect Amplicon ist ein einzigartig konzipierter Service für Wissenschaftler, die Amplikons jeglicher Länge sequenzieren möchten. Dieser Service bietet dem Forscher die Möglichkeit Sequenzierungskapazitäten auf den Plattformen Illumina oder PacBio zu nutzen. NGSelect Amplicon bündelt zwei technologische Möglichkeiten mit flexiblen Datenpaketen.
Adaptor Ligation Protokoll:
- Sie bereiten entweder PCR Produkte ohne Tags (=molekulare Barcodes) vor, oder einen Pool von PCR-Produkten die mit Tags versehen sind.
- Eurofins Genomics ligiert Sequenzieradaptoren für die Sequenzierung mit der Illumina oder PacBio Technologie
2nd PCR Protokoll:
- Sie bereiten Ihre PCR Produkte mit spezifischen universellen Sequenzen vor (siehe Sample Submission Guidelines)
- Eurofins führt einen 2. PCR-Schritt durch, der Indices für die spätere Unterscheidung der Proben und Illumina-Sequenzieradaptoren einführt
Da für die Illuminasequenzierung kurzer Amplikons beide Technologien in Frage kommen, unterstützen wir Sie mit nachfolgender Tabelle dabei, den besten Ansatz für Ihr Projekt zu finden.
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Anwendungsbereiche
NGSelect Amplicon kann für eine Vielzahl von Anwendungsbereichen eingesetzt werden. Zu den gängigsten Verwendungsmöglichkeiten des Produkts zählen folgende:
- Screening auf genetische Varianten in komplexen Proben
- Amplikon-Sequenzierung ganzer Gene
- Analyse von schwer sequenzierbaren Genomregionen wie z. B. stark repetitiven Bereichen, GC-reichen Bereichen oder Haarnadelstrukturen
- Haplotypen-Phasierung zur Analyse der genetischen Kovarianz
- HLA-Allel-Typisierung
- Sequenzierung von CRISPR editierten Sequenzbereichen (auch als Komplettservice verfügbar)
- Sequenzierung des 16S-rRNA-Gens zur Charakterisierung von Mikroorganismen (auch als Komplettservice verfügbar)
Besonderheiten von NGSelect Amplikon
- Sequenzierung von Amplikons mit einer Größe von 100 bp bis 6 kb
- Große Auswahl an Illumina- oder PacBio-Sequenzierungsoptionen
- Hochsensitive NGS-Arbeitsabläufe mit reduziertem Bias
- Flexible Datenpakete ab 80 – 90 k Read Paaren
- Pooling von bis zu 192 Illumina Proben oder 10 PacBio Proben möglich