w7.1.04 | c7.1.57.01.04
PROD | u6.1.6
 

 

Häufig gestellte Fragen zu Produkten und Dienstleistungen



Welches Probenmaterial benötigen Sie für die Sequenzierung von großen Vektor-Konstrukten, wie z.B. BACs, PACs, Fosmiden oder Cosmiden?

Bitte versenden Sie E. coli Glycerin- oder Stichkulturen, die das Vektor-Konstrukt enthalten.

Ist es möglich, die verbleibende BAC-, PAC-, Fosmid- oder Cosmid-DNA zu erhalten?

Ja. Auf Anfrage lassen wir Ihnen die verbleibende DNA zukommen. In diesem Fall müssen wir zusätzliche Kosten für die Abwicklung und den Versand berechnen.

Wie viel Probenmaterial benötigen Sie für die Sequenzierung von kleinen Genomen, wie z.B. Viren, Phagen oder Organellen-DNA?

Wir können Ihr Projekt mit nur 100-200 ng DNA durchführen. Eine geringe Kontamination mit genomischer DNA ist akzeptabel, solange diese unter 10% liegt. Trotzdem empfehlen wir den Versand von nicht kontaminiertem Probenmaterial, da dies das Auftreten von kontaminierenden Sequenzen verhindert.

Wir empfehlen wenn möglich den Versand von 5-10 µg Probenmaterial. In diesem Fall können wir auf die Amplifikation verzichten, die wir bei kleineren DNA-Mengen anwenden müssen.

Was bedeutet Coverage-Sequenzierung?

Bei der Coverage-Sequenzierung wird die DNA so lange sequenziert, bis eine bestimmte Menge an Sequenzinformation - und somit eine bestimmte Abdeckung der Sequenz - erreicht ist.

Beispiel: Für eine einfache Coverage (Abdeckung) eines BACs von 150 kb müssen 150.000 Basenpaare sequenziert werden. Für eine 6-fache Coverage ist die Sequenzierung von 900.000 Basenpaaren nötig.

 

Wie viele Läufe pro BAC, PAC, Fosmid oder Cosmid werden benötigt?

Das hängt von der Größe Ihrer BACs, PACs, Fosmide oder Cosmide und der benötigten Coverage ab.

Beispiel: Ein viertel Segment eines vollen Laufs ist ausreichend, um ein Set von 24 BACs von 150 kb mit einer 20-fachen Coverage zu sequenzieren.

Bitte beziehen Sie sich auf Ihr individuelles Angebot.

Wie liefern Sie die Sequenzierdaten?

In Abhängigkeit der Datenmenge erhalten Sie DVDs, USB-Sticks oder Festplatten.

Zusätzlich haben Sie die Möglichkeit, Ihre Daten von unserem "secure FTP" Server herunterzuladen.

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